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クリニックの税理士顧問料はいくら?相場と考え方を解説

2026
01/21
クリニックの税理士顧問料はいくら?相場と考え方を解説
2026年01月21日
クリニックの税理士顧問料はいくら?相場と考え方を解説

クリニック経営において税理士へ顧問を依頼する際、多くの院長が最初に気になるのが顧問料の金額です。「毎月いくらかかるのか」「この費用は本当に必要なのか」「顧問料に見合うサポートが受けられるのか」といった疑問を持つのは自然なことと言えるでしょう。

一方で、税理士顧問料は単なる固定費ではなく、経営の安定や判断の質を左右する重要な要素でもあります。顧問料の考え方を誤ると、必要なサポートが受けられず、結果として経営リスクを高めてしまう可能性もあります。

本記事では、クリニックが税理士へ顧問を依頼する際に知っておきたい顧問料の相場感や決まり方、注意点、そして費用の捉え方について、実務の視点から詳しく解説します。

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クリニックの税理士顧問料の相場

クリニックの税理士顧問料には明確な定価があるわけではなく、クリニックの状況や依頼内容によって大きく異なります。そのため、相場を把握する際には「なぜ金額に幅があるのか」という点もあわせて理解しておくことが重要です。

一般的には、月額顧問料として数万円から十数万円程度が目安とされることが多いですが、これはあくまで参考値です。実際には、個人クリニックか医療法人か、対応業務の範囲、相談体制などによって金額は変動します。

個人クリニックの場合の顧問料の目安

個人事業として運営しているクリニックの場合、会計や税務の構造が比較的シンプルなため、顧問料は抑えめに設定されるケースが多く見られます。日常的な記帳内容が整理されており、相談頻度が少ない場合には、月額数万円程度から顧問契約を結べることもあります。

ただし、自由診療の割合が高いクリニックや、スタッフ数が多い場合には注意が必要です。売上構造や人件費管理が複雑になるため、税理士の関与範囲も広がり、その分顧問料が上がることがあります。

金額だけでなく、どこまで対応してもらえるのかを確認することが大切です。

医療法人の場合の顧問料の目安

医療法人では、法人税申告に加えて、役員報酬の設計や個人側の税務も含めた対応が必要になります。個人クリニックと比べて会計処理や判断事項が増えるため、顧問料は高めに設定される傾向があります。

一方で、医療法人の場合は税務判断が経営全体に与える影響も大きくなります。そのため、顧問料が高くなったとしても、経営の安定や将来設計を考えると、専門的なサポートを受ける価値は十分にあると言えるでしょう。

税理士顧問料が決まる主な要素

税理士顧問料は、売上規模だけで一律に決まるものではありません。クリニックごとの状況や、税理士にどこまでの業務を求めるかによって総額は大きく変わります。

対応業務の範囲による違い

税理士に依頼する業務範囲によって、顧問料には大きな差が生じます。たとえば、月次の会計チェックのみを依頼する場合と、記帳代行、決算対応、節税の検討まで含めて依頼する場合とでは、税理士側の関与度合いが大きく異なります。

業務範囲が広がるほど顧問料は高くなりますが、その分、院長自身が対応しなければならない実務は大幅に軽減されます。日々の会計処理や数字の整理に時間を取られず、診療やスタッフ管理、経営判断に集中できる点は大きなメリットです。

どこまでを税理士に任せ、どこを院内で対応するのかを事前に整理したうえで顧問契約を検討することで、顧問料とサポート内容のバランスを取りやすくなります。

単に顧問料の金額だけを見るのではなく、実際に受けられる支援内容を具体的に確認することが重要です。

面談・相談体制の違い

税理士事務所によって、面談や相談の体制には大きな違いがあります。定期的に面談を行う事務所もあれば、必要に応じて随時相談できる体制を重視している事務所もあります。

面談頻度や相談対応の柔軟さは、顧問料に反映されることが一般的です。相談回数に制限がある場合、些細な判断を後回しにしてしまい、結果として経営判断が遅れるケースも考えられます。

特に、経営判断を行う場面が多いクリニックでは、気軽に相談できる体制が整っているかどうかが、顧問料以上に重要な判断材料になることもあります。

顧問契約を結ぶ際には、面談の頻度や相談方法についても具体的に確認しておくことが大切です。

クリニックの成長フェーズ

開業直後のクリニックと、成長期に入ったクリニック、さらに医療法人化を検討している段階のクリニックでは、税理士に求められる役割は大きく異なります。

開業直後は、資金繰りや日々の収支管理を安定させることが最優先となりますが、売上が伸び始めると、人件費や広告費、設備投資のバランスといった経営判断が重要になってきます。

成長フェーズに入ると、節税の考え方や将来を見据えた資金計画、医療法人化の検討など、より中長期的な視点でのアドバイスが求められるようになります。その結果、対応業務の範囲が広がり、税理士顧問料が見直されるケースも少なくありません。

重要なのは、顧問料の増減そのものではなく、クリニックの成長段階に応じた適切なサポートを受けられているかどうかです。

フェーズに合った支援を受けることで、無理のない経営判断につながり、長期的に安定したクリニック運営を実現しやすくなります。

顧問料の安さだけで税理士を選ぶリスク

税理士顧問料を比較する際、どうしても金額の安さに目が向きがちですが、顧問料だけを基準に判断することには注意が必要です。

一見コストを抑えられているように見えても、実際には必要なサポートが十分に受けられていないケースもあります。

特にクリニック経営では、税務や会計の判断が経営判断そのものに直結します。そのため、サポート体制が不十分な状態が続くと、後になって大きな修正や見直しが必要になる可能性があります。

顧問料だけを基準に判断することの問題点

顧問料が低く設定されている場合、対応業務の範囲が限定されていたり、相談回数や相談内容に制限が設けられていることがあります。その結果、日常的な判断を院長自身が抱え込むことになり、経営判断の負担が増してしまうケースも少なくありません。

また、医療業界特有の論点に十分対応できない場合、判断の遅れや見落としが生じる可能性もあります。短期的な顧問料の安さだけで判断すると、結果的に時間的・金銭的な負担が増えるリスクがある点には注意が必要です。

クリニックにとって適切な顧問料の考え方

クリニックにとっての税理士顧問料は、「安いか高いか」だけで判断するものではありません。重要なのは、その顧問料でどのような支援を受けられるのか、経営判断にどの程度寄与しているのかという点です。

顧問料はコストであると同時に、経営を安定させるための投資とも言えます。そのため、金額だけを切り取るのではなく、支援内容とのバランスを見て考えることが重要です。

顧問料は「支援内容」とのバランスで考える

税理士がどこまで経営に関与し、どの程度の頻度で相談できるのかによって、顧問料の価値は大きく変わります。数字を整理するだけでなく、経営課題を可視化し、判断材料を提示してくれる体制が整っていれば、顧問料以上の価値を感じられるケースもあります。

院長が診療に集中しながらも、経営状況を把握しやすくなる環境を整えられるかどうか。その視点で顧問料を捉えることが、クリニックにとって適切な税理士選びにつながります。

クリニック経営を支えるパートナーとしての千代田税理士法人

税理士顧問料について悩んだときは、金額だけで判断するのではなく、現状の課題や将来の経営方針を整理したうえで専門家に相談することが重要です。クリニックの状況によって、適切な顧問料や支援内容は変わります。

千代田税理士法人では、クリニックの税務・会計をはじめ、経営フェーズに応じた継続的なサポートを行っています。顧問料についても、業務内容や支援範囲を丁寧に整理したうえで、各クリニックの状況に合わせた提案を行っています。

顧問料に不安や疑問がある場合でも、現状を整理するところから相談することで、無理のない判断につながります。クリニックの税務や顧問契約について検討している場合は、千代田税理士法人までご相談ください。

市邉 隆志

このコラムを監修した税理士

市邉 隆志


千代田税理士法人代表。 会計税務は専門分野としてもちろんのこと、多種多様なご相談に応えていくためには、所員に長く勤めてもらい、教育と経験を積み重ねて行く事が常に必要とされます。 私たちはお客様にとっての日本一の会計事務所になるために、離職率ゼロを目標ともしています。 当社に安心して任せてください。 お客様にとっての日本一のサービスを提供し続けていきます。

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